Em 1617 estava concluída a grande obra da dinastia Filipina em Tomar, o aqueduto dos Pegões. Foto 1, Foto 2

Logo no ano seguinte, Filipe II quis dar uma entrada mais nobre ao Convento e que desse passagem directa para a sua parte mais importante, a igreja. Manda então construir a portaria Real, ou Filipina. Foto 3, Foto 4, Foto 5, Foto 6

Esta obra mudou muito o aspecto do lado norte do convento/castelo. Além de modificar as fachadas dos claustros da Micha e da Hospedaria, também foi derrubada mais uma parte da muralha do castelo. Foto 7

O claustro Principal, também chamado dos Filipes, não modificou muito a sua aparência no tempo destes reis. Aliás, as maiores mudanças deram-se por causa da chegada da água ao Convento. Foto 8, Foto 9, Foto 10

Se os Pegões foram a grande obra; se a Portaria foi a que mais modificou o castelo/convento; a sacristia Nova, sendo a mais pequena, é a mais ricamente decorada. Foto 11, Foto 12, Foto 13, Foto 14, Foto 15, Foto 16, Foto 17, Foto 18. Está “colada” ao claustro do Cemitério, que D. Henrique construiu no século XV, e foi erguida para servir a igreja templária-manuelina. Foto 19, Foto 20.